STAGES M2 MMPEM 2017-2018

De nouveaux sujets seront proposés prochainement. Consultez régulièrement la liste des stages.

Prenez contact dans les plus brefs délais avec les reponsables des sujets qui vous intéressent.


                                                                                  EN BLEU: SUJETS LIBRES

                                                                                  EN ROUGE: SUJETS DEJA POURVUS PAR UN CANDIDAT


I - UMR 5557 - ECOLOGIE MICROBIENNE - (CNRS- INRA- VetAgroSup- UCB LYON 1)

1.1. Caractérisation des populations d'Aeromonas aérosolisées en milieu urbain: diversité génétique et description des voies de résistance aux stresses environnementaux 

1.2. Incidence de la voie de détoxication TPMT (thiopurine S-méthyle transférase) dans la répartition environnementale des Pseudomonas aeruginosa

1.3. Réponse des communautés eucaryotes à des conditions environnementales contrastées dans le lac Dziani Dzaha (Mayotte) : de la diversité à la fonction.

1.4. Impact de l’essence forestière sur la diversité et les interactions entre systèmes enzymatiques fongiques impliqués dans la dégradation des lignines

1.5. Impact de différents génotypes de blé sur la diversité du groupe fonctionnel des bactéries rhizosphériques produisant de l’auxine

1.6. Etude de la relation entre le nombre de fonctions phytoprotectrices co-occurrentes chez des bactéries et leur capacité à inhiber la croissance de microorganismes phytopathogènes

1.7. Propriétés anti-adhésives des membranes des globules gras laitiers réduisant la colonisation du tractus intestinal par les E. coli producteurs de shiga-toxines

1.8. Rôle d'une protéine luxR orpheline chez le phytopathogène Agrobacterium tumefaciens C58

1.9. Etude des effecteurs synthétisés par Frankia alni par approche de gain-de-fonction en hôte hétérologue

1.10. Etude des modalités d'association entre les levures et le moustique tigre Aedes albopictus 

1.11. Expression du système de sécrétion de type VI d’Agrobacterium et avantage écologique

1.12. Etude du lien entre formation de biofilm et taux intracellulaire du signal di-GMP cyclique chez la bactérie phytostimulatrice Azospirillum

1.13. Analyse comparative de l'anatomopathologie comparée de souches de Nocardia abscessus humaines et urbaines sur modèle murin.

 

II - UMR 5240 - Microbiologie, Adaptation et Pathogénie - (CNRS- INSA- Bayer CropScience- UCB LYON 1)

2.1. Etude d’une protéine membranaire dans la virulence de Dickeya dadantii

2.2. Recherche des riboprotéines impliquées dans la régulation de la virulence de Dickeya dadantii

2.3. Chitine et camouflage moléculaire chez le champignon phytopathogène Botrytis cinerea

2.4.Importance du trafic vésiculaire chez le champignon phytopathogène Botrytis cinerea : impact sur la virulence du pathogène.

2.6. Tn-seq de souches environnementales de Pectobacterium et mise au point du CrispRi chez Pectobacterium et Dickeya.



III - UMR 5086 - IBCP - UCB LYON 1 -

3.1. Etude biochimique et structurale du système de sécrétion de type IV d’Helicobacter pylori

3.2. Real-time visualisation of drug resistance acquisition by bacterial conjugation


IV - Laboratoire Ampère - Ecole Centrale LYON

4.1. Rôle de l’atmosphère dans la dispersion des bactéries résistantes aux antibiotiques

4.2. Quantification of  a wild-type/arbuscular mycorrhizal fungi deficient-mutant plant system for use in soil microbial community experiments


V - ANSES LYON

 


VI - VirPath (Centre International de Recherche en Infectiologie, INSERM U1111, CNRS UMR5308, ENS Lyon, UCB LYON 1)

6.1. Etude des interactions hôte-pathogène dans le contexte d’infections et co-infections bactériennes/virales dans un système 3D d’épithélium respiratoire humain reconstitué.

6.2. Neuraminidase N8 et mutations de résistance à l’oseltamivir     SUJET SUPPRIME


VII - UMR 454 MEDIS - Microbiote Environnement Digestif et Santé  - CLERMONT-FERRAND

7.1. Participation à la mise en place d’un modèle in vitro de dysbiose intestinale chez le porcelet en post-sevrage


VIII - BF2I - Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (INRA/INSA Lyon)

8.1. Impact de la symbiose sur le développement : Etude du dialogue moléculaire hôte-bactérie pendant la métamorphose d’un insecte endosymbiotique

 

IX - UMR Agroécologie, INRA DIJON

9.1. Différenciation de niche, syntrophie et exclusion compétitive : Mise en évidence et quantification deces processus dans des environnements de sélection à complexité variable.


X - Université Laval, QUEBEC

        10.1. Impact de la présence d'une couverture de glace sur les communautés microbiennes planctoniques et sédimentaires d'une rivière canadienne en hiver