SUJETS de STAGE M2 MMPEM 2026-2027
Les sujets portant la mention PMIP sont également ouverts aux candidats envisageant de suivre le parcours de M2 PMIP.
Les sujets dont l'intitulé est en rouge sont pourvus par un candidat. Les candidats peuvent également effectuer une démarche autonome de recherche de stage.
Les équipes souhaitant déposer un sujet sont invitées à contacter les responsables (F. Wisniewski & F. Hommais).
I - UMR 5557 - ECOLOGIE MICROBIENNE (UCB LYON 1 - CNRS - INRAE - VetAgro Sup)
1.1. Microbiote larvaire et valorisation des déchets azotés : un levier du succès d’Aedes albopictus – P. LUIS & A. VIGNERON
1.2. Impact des nanoplastiques sur les interactions amibe-bactérie – W. LIU & T. MEYER
1.3. Une solution fondée sur la nature basée sur l’utilisation d’Alnus cordata pour la préservation des ripisylves en région de la Dombes – S. KIM TIAM & A. HERRERA-BELAROUSSI (PMIP)
1.4. Les amibes : terrain fertile pour l’émergence de la virulence de la bactérie Stenotrophomonas maltophilia ? – S. FAVRE-BONTE & E. KAY
1.5. Caractérisation du rôle de sRNA contenus dans les vésicules extracellulaires de Chryseobacterium, bactérie du microbiote du moustique tigre Aedes albopictus – A. VIGNERON & L. VIAL
1.6. Écologie des déterminants de la virulence bactérienne dans des anthrosols urbains contaminés aux HAPs – W. GALIA & G. SCHWOB
II - UMR 5240 - Microbiologie, Adaptation et Pathogénie (UCB LYON 1 - CNRS - INSA- Bayer CropScience)
2.1. Universalité et conservation structurale de la triche sociale médiée par l'ARN petit régulateur ArcZ chez les entérobactéries phytopathogènes et animales – E. GUEGUEN & L. ATTAIECH
III - Centre International de Recherche en Infectiologie (INSERM U1111 - CNRS UMR5308 - ENS Lyon - UCB LYON 1)
3.1. Impact des modifications post-transcriptionnelles des ARNt sur la virulence de Staphylococcus aureus – K. MOREAU & L. PUAUD
3.2. Characterization of spike proteins of potential zoonotic coronaviruses isolated from bat reservoirs in a tropical forest in Southern Cameroon – C. FAGE & O. TERRIER
IV - UMR 5086 Molecular Microbiology and Structural Biochemistry (UCB LYON 1 IBCP - CNRS)
4.1. Caractérisation de nouvelles voies de régulation de la différenciation cellulaire chez Caulobacter crescentus : rôle de kinases alternatives - M. GUZZO
4.2. Caractérisation du rôle de l’opéron repC-pifA du plasmide conjugatif F dans le mécanisme d’inhibition de fertilité de plasmides co-résidants chez la bactérie Escherichia coli - J. CAYRON & C. LESTERLIN
4.3. Régulation du transfert conjugatif du plasmide clinique pOXA-48 et impact sur la fitness bactérienne – S. BIGOT
V - UMR 5306 Institut Lumière Matière
VI - UMR 5242 Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon
6.1. Lactiplantibacillus plantarum extracellular vesicles as drivers of host growth: mechanisms of vesiculogenesis and cargo – R. MATOS
VII - BF2I - Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (INRAE - INSA Lyon)
7.1. Effets de la symbiose sur la composition du miellat excrété par le puceron du pois en utilisant des insectes aposymbiotiques produits sur plantes – L. GERLIN & Y. QUIVET (PMIP)
VIII - IRHS - Institut de Recherche en Horticulture et Semences (INRAE - Univ. Angers)
8.1. Traits bactériens impliqués dans la primo-colonisation des plantes – M. BARRET & A. LE SIOU
IX - UMR Agroécologie - Dijon
X - LIPME - Laboratoire des Interactions Plantes-Microorganismes-Environnement (INRAE Toulouse)
XI - Toulouse Biotechnology Institute,- Toulouse
XII - Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD) - INSERM/INRAE/Université, Toulouse
12.1. Le vagin comme réservoir d’E. coli : rôle de la colibactine dans la persistance et les récidives urinaires – C. CHAGNEAU & T. BIZEAU
12.2. Caractérisation des voies de régulation et du rôle de l’hémolysine F chez les Escherichia coli pathogènes – P. BRANCHU
XIII - Laboratory of Applied Space Microbiology, University of Bremem
XIV - Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg
XV - Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB), Marseille
15.1. Une population, plusieurs stratégies ? Comprendre l’adaptation métabolique chez les bactéries lactiques cellule par cellule – S. TACHON
XVI - Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires - Toulouse
XVII - INRAE-BIOGER, Palaiseau
XVIII - UMR Procédés Alimentaires et Microbiologiques, Institut Universitaire de la Vigne et du Vin, Université de Bourgogne
18.1. Etude des mécanismes de bioprotection des levures par microfluidique – H. ALEXANDRE (PMIP)
18.2. Comparaison de méthodes de quantification de Brettanomyces bruxellensis dans les vins par qPCR, PCR digitale et cytométrie en flux : développement et optimisation d’une approche de PCR digitale pour le contrôle microbiologique des vins – H. ALEXANDRE & V. DAVID
XIX - Unité Dynamique des génomes et adaptation microbienne (DynAMIC), Université de Lorraine/INRAE
XX - Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale, Toulouse
XXI - Diversité, Génomes & Interactions Microrganismes-Insectes (DGIMI, UMR 1333), Montpellier
21.1. Impact des peptides spécialisés bactériens dans les interactions interspécifiques et la structuration du microbiote des nématodes entomopathogènes – A. GIVAUDAN (PMIP)
XXII - Laboratoire de Parasitilogie et Mycologie Médicales, Lyon
22.1. Etude de la relation entre degré d’exposition fongique environnementale domiciliaire évalué par métagénomique ciblée, co-occurrence de pathogènes bactériens et symptômes cliniques de patients présentant une broncho-pneumopathie chronique obstructive – J. MENOTTI & B. COURNOYER
XXIII - UMR 454 MEDIS - Microbiote Environnement Digestif et Santé - CLERMONT-FERRAND
XXIV - LEMiRE, CEA Cadarache
XXV - UR 4651, Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements, Université CAEN
XXVI - UMR 1355 Institut Sophia Agrobiotech, INRAE Nice
XXVII - Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires - LISM (CNRS - Univ. Marseille)
XXVIII - ANSES, Unité B3PA (Bactériologie et Parasitologie des Produits de la Pêche et de l’Aquaculture) - Boulogne/Mer
XXIX - ANSES, Unité AB2R (Antibiotics, Biocides, Residues & Resistance) - Fougères
XXX - ANSES, Unité EMAD (Experimentation, Modelling and Data Analysis) - Fougères
XXXI - Unité Mycologie et Santé des Aliments, INRAE Bordeaux
XXXII - Unité Biologie et Gestion des Risques en Agriculture, INRAE & Univ. Paris-Saclay
XXXIII - Unité Pathologie Végétale - INRAE, Montfavet